Der letzte Auftrag beginnt, wenn die Nanotechnologie von Desty Nova Alita in der schwimmenden Stadt Tiphares wiederbelebt. Die schwarzen Geheimnisse der Stadt sind bösartig entlarvt, aber es scheint ein kleiner Teil einer Welt zu sein, die kompliziert ist. Alita geht mit alten und neuen Unternehmen ins All, um mehr über ihre vergessene Vergangenheit zu erfahren und nach ihrem verlorenen Kumpel Lou Collins zu suchen. Sie ist in einen interplanetaren Kampf zwischen den Hauptmächten des kolonisierten Sonnensystems verwickelt. Unterwegs schließt sie eine Allianz mit drei der Alita-Repliken, die jetzt anfangen, für sich selbst zu glauben, einem unappetitlichen Superhacker, und Nova selbst, wenn sie am Zenith of Things-Turnier (ZOTT) teilnimmt, einem Kampfwettbewerb, der alle 10 Jahre stattfindet. Einschließlich der Art und Weise, wie die Erde nach einem katastrophalen Aufprallwinter erschien, der die Mehrheit der Öffentlichkeit während der gesamten Länge der Erzählung auslöschte, wird mehr Geschichte in Bezug auf die Kulisse von Battle Angel Alita gezeigt, die in der früheren Folge nicht offenbart wurde.
